AI与原子力显微镜联合,直接获得原子结构分析效果

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研究人员开发了以最小尺度研究质料的新方法

世界各地的科学家都对开发新型质料感兴趣,以资助人们过上更可连续、更康健的生活,可是要生产这些质料,需要对它们所组成的分子的神秘结构有详细的相识。设计人员希望用可连续的植物衍生化合物取代浪费的塑料,可是如果不相识植物化合物的分子结构,这将是一个挑战。阿尔托大学(Aalto University)开发的一项新技术应使研究人员能够获得这些基本信息。

为了实现这一目的,研究人员将通用的质料分析技术与人工智能相联合。原子显微镜(AFM)使用难以置信的细针来丈量纳米级物体的巨细和形状,而且已经可以用于丈量扁平的薄饼状平面分子的结构。通过在大量AFM数据上训练人工智能算法,科学家现在可以通过令人兴奋的现实应用来识别更庞大的分子。

AFM成像历程的示意图以及逆成像问题的建议解决方案

该团队现在能够拍摄单个3维分子的图像,并具有足够的细节,从而有可能相识分子差别部门的差别化学性质。这项事情是由阿尔托大学的研究人员在学院教授彼得·利耶罗斯(Peter Liljeroth)以及亚当·福斯特(Adam S. Foster)和朱霍·坎纳拉(Juho Kannala)教授的领导下完成的。最近揭晓在“科学希望”杂志上。

“研究人员现在使用的方法是推测结构,凭据AFM图像模拟并检查推测是否正确。当存在多种可能性时,这是缓慢而难题的,最终人们无法确定是否想到了所有可能的结构。”彼得·利耶罗斯解释说。

研究人员使用了一种称为1S-camphor(樟脑)的生物分子,该分子具有众所周知的原子结构,而且作为木料工业的生物产物,与其他阿尔托研究人员对生产可连续产物感兴趣的许多分子相似。通过联合机械学习和AFM模拟,福斯特教授的团队开发了一种深度学习系统,该系统将一组AFM图像与其分子结构相匹配。首先,在模拟的AFM数据上测试了机械学习系统,分析了具有平面和非平面几何形状的种种分子。为了测试其有效性,使用了大量实验数据并取得了令人兴奋的效果:AI能够可靠、快速地解释庞大3-D分子的AFM图像,并说明其化学性质。

AFM图像,模拟图像和原子结构分析效果

该论文的第一作者本杰明·奥尔德里特(Benjamin Alldritt)解释说:“这项研究令人兴奋,因为它为我们提供了使用当前实验方法相识质料的新方法。通过将机械学习与AFM相联合,我们可以相识以前无法实现的3-D结构图像。此外,这种新方法在确定分子在外貌上的位置方面比现有方法要快,而且比人类专家更快,更可靠。