使用数字成像技术对小麦籽粒及其与产量增加的关系举行遗传分析

本文提出使用基于盘算机的智能谷物软件，获取55个小麦焦点基因型的种子形状表型数据，植物表型资讯先容如下。

数字成像技术（DI）可以通过差别成像偏向捕捉小麦籽粒巨细和形状的三维变化。联合简朴序列重复（SSRs）标志的关联映射和数字成像可能有助于识别控制籽粒形态的基因组区域。据此，本文提出使用基于盘算机的智能谷物软件，获取55个小麦焦点基因型的种子形状表型数据，包罗种子体积、面积、周长、长度、宽度、长宽比、圆度、偏离椭圆的水平偏差（HDEV）、偏离椭圆的垂直偏差（VDEV）、因子形态密度（FFD）等。效果发现，千粒重（TGW）与粒径直接丈量值呈正相关；而VDEV、FFD等衍生的籽粒属性与TGW无相关或负相关。

AA01基因型A)水平种子图，B)垂直种子图

A)使用SmartGrain举行数码图像分析的步骤;B)SmartGrain分析的种子图像显示丈量尺寸

数字成像将基因型正确地划分为明确群。首先使用非毗连SSR标志举行贝叶斯结构分析，将研究的小麦基因型进一步分成两个亚群。然后使用混淆线性模型（MLM）方法举行全基因组分析，发现许多染色体区域的位点与籽粒形态相关。最后使用未开发的tauschii质料，在1D和2D染色体上发现大量的标志-性状组合（MTAs）可能携带能够提高粒重潜力的新等位基因。另外，本文还展示了多种方法的应用，包罗使用DI举行高通量表型分析，辅以全基因组关联研究来确定这些特征的潜在候选基因组区域，从而可以更好地相识小麦籽粒的分子遗传学。

种子巨细和形状形貌符对粒重直接和间接影响的通径分析

基于小麦种子影像数据的基因型聚类分析(UPGMA)

泉源：

Ali A , Ullah Z, Alam N,et al. Genetic analysis of wheat grains using digital imaging and their relationship to enhance grain weight. Sci. agric. (Piracicaba, Braz.) vol.77 no.6 Piracicaba 2020 Epub Jan 24, 2020.http://dx.doi.org/10.1590/1678-992x-2019-0069.