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摘要

由于溃疡性结肠炎(UC)相关性大肠癌(CRC)和散发性大肠癌在临床体现和分子特征上差别，我们试图评估DNA甲基化对基因表达影响的差异。

研究效果

图1：按组织表型区分的甲基化位点。

a)显示每次比力之间重叠甲基化位点数量的维恩图。

b)热图表现UC相关结肠癌和相近的非发育不良UC组织之间的无监视分级聚类。

c)表现散发性结直肠癌和相邻正常组织之间无监视分级聚类的热图。

图2：全基因组转录分析区分UC和散发性结肠癌。

使用RNA测序数据举行主身分分析，比力A)UC-结肠癌、UC癌相近的非发育不良组织、散发性结肠癌和散发性结肠癌相近的正常组织；B)UC相关的结肠癌和相近的非发育不良UC组织；以及C)散发性结肠癌和相近的正常组织。

d)与散发性结肠癌相比，IBD癌症中的GAGE通路显著富厚。

e)维恩图显示UC相关结肠癌与炎症活跃的相近组织和UC相关的结肠癌相比，与相近组织中无炎症(静止)的相比，差异表达基因的数目。

图3：溃疡性结肠炎患者中DNA甲基化和RNA转录本表达呈反向关系的基因。

相关图显示了y轴上的转录表达和x轴上包罗18个基因的32个位点的归一化DNA甲基化值，这些基因在UC癌和癌旁组织中的转录表达有显着差异(p值

图4：ANPEP、FAM92A和STK31在UC相关癌中的表达。

用针对A)ANPEP、B)FAM92A和C)STK31的抗体在正常对照组、UC相关结肠癌和结肠癌旁UC组织中举行免疫组织化学染色。UC相关癌症和相近的非增生组织的代表性图像以10倍的放大倍数拍摄，插图以40倍的倍率放大。

结论

DNA甲基化对转录物表达的调治涉及到结肠癌发生的关键基因，这可能解释了IBD和散发性结肠癌在体现和预后上的差别。

DOI：10.1093/ecco-jcc/jjz014

参考文献

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